在联盟建设方面，以解决行业、产业和区域性重大问题为导向，整合优势科技资源，搭建多学科协同、科企紧密协作、科技创新上中下游衔接的平台。按照“建起来、干起来、强起来”三步走战略，目前已经建设了50多个联盟，并推动联盟围绕创新任务干起来。今年以来，正在按照“内生机制要落地、核心成果要落地、实体化运行要落地”的要求把联盟“强起来”，重点打造了20个标杆联盟，这些联盟以保障绿色农产品有效供给和产业结构调整为主攻方向，凝练了117项年度创新任务，整合了5.7亿元各类资金，吸纳了343家科研机构、推广单位、企业和1923名科研骨干参加，推动了华北平原小麦玉米节水节肥等40项联盟科技成果转化落地。重点形成了实体化运行、一体化协同、共建共享三大机制。
在科创中心建设方面，以科技创新为基础、产业化为方向，着力推动要素集聚、关键技术集成、关联企业集中、资源配置集约、优势产业集群，会同地方政府创建一批科技创新能力强、科技型企业强、辐射带动能力强的国家现代农业产业科技创新中心。目前，已批复建设的江苏南京、山西太谷、四川成都三地国家现代农业产业科技创新中心各具特色、开局良好。太谷科创中心已投入1.8亿元专项资金，围绕杂粮杂豆、设施蔬菜、干鲜果业等地方特色优势产业，规划建设了“一城三园五区”的总体布局。江苏南京、四川成都两个中心也聚焦优势领域或产业，加大投入、创新机制，推进科企合作，即将形成优势产业集群，带动地方农业快速发展。